2025 Bewegingsafwykings Resensieartikel van die Jaar
Verkenning van neurodegeneratiewe siektes met behulp van langlees-volgordebepaling en optiese genoomkarteringstegnologieë 

---

Tweet

Ons is verheug om die "2025 Oorsigartikel van die Jaar"-toekenning te ontvang. Bewegingsafwykings joernaal. Nadat dit aan Bewegingsafwykings 'n artikel wat twee broers en susters beskryf met 'n fenotipe versoenbaar met PRKN-geassosieerde Parkinson se siekte (PS) opgelos deur langlees-volgordebepaling (LRS), het die hoofredakteur ons vriendelik genooi om 'n resensie te skryf wat fokus op opkomende tegnologieë vir 'n nie-genetici-gehoor.

Ons het geglo dat hierdie oorsig op die regte tyd gekom het om twee redes. Eerstens het meer mense LRS in die konteks van neurodegeneratiewe siektes gebruik, en 'n groeiende hoeveelheid bewyse uit die literatuur het die vermoë daarvan bewys om gevalle op te los wat onverklaarbaar is deur volledige eksoom- of volledige genoomkortleesvolgordebepaling. Tweedens is die mees onlangse oorsig in 2021 deur Su et al. in Neurology gepubliseer, daarom het 'n opdatering nodig gelyk. Ons was bly om die skrywe te aanvaar en het ten doel gehad om 'n breë perspektief te bied op die onlangse prestasies van beide LRS en optiese genoomkartering (OGM), sowel as hul beperkings, uitdagings en geleenthede vir die toekoms. 

Daar is drie hooftipes genetiese variasies wat menslike eienskappe beïnvloed: klein variante (variante wat minder as 50 basispare insluit, ook genoem enkelnukleotiedvariante en invoegings/delesies), kort tandemherhalings (ook bekend as herhalingsuitbreidings-RE's), en strukturele variante (SV's, delesies, invoegings, duplikasies, inversies, translokasies). Baie waarskynlike monogeniese afwykings het steeds nie akkurate molekulêre diagnose nie, hoofsaaklik omdat konvensionele volgordebepalingsmetodes nie effektief is om SV's en RE's op te spoor nie, wat albei oorsaaklik is in baie neurogenetiese siektes. Daarom is verskeie inisiatiewe daarop gemik om LRS en/of OGM te gebruik om die genetiese onderbou van neurodegeneratiewe siektes te ontsyfer. Ons het verskeie omvattende voorbeelde in die oorsig verskaf om die leser 'n begrip te bied van die prestasies van LRS en OGM. Ons bespreek hoe LRS ons toegelaat het om variante te onthul wat nie deur kortleesvolgordebepaling in bekende neurodegeneratiewe siektes genoem word nie (bv. PRKN, SPG4) en nuwe oorsaaklike gene te ontdek (bv. Neuronale Intranukleêre insluitingsiekte en NOTCH2NLC 5'UTR-uitbreiding, Spinocerebellêre ataksie tipe 4 en ZFHX3). Ons illustreer ook die vermoë van LRS om die grootte en motief van herhalings te karakteriseer, wat die ouderdom van aanvang, penetransie, oorerwing en kliniese fenotipes beïnvloed (CANVAS en RFC1, FXTAS en FMR1, SCA27B en FGF14). Ons beskryf ook die moontlikheid om variante te faseer met behulp van LRS en variante in gene te onderskei van dié in hul pseudogene (GBA1, SORD2), sowel as die moontlikheid om nuwe transkripsies te identifiseer. Ons beklemtoon ook die voor- en nadele van optiese genoomkartering in die identifisering van SV's en RE's. Alhoewel hierdie tegnologieë tans meestal in 'n navorsingsomgewing gebruik word, verwag ons breër implementering in kliniese laboratoriums in die toekoms. Ons hoop dat hierdie oorsig nuttig is vir professionele persone om hul nut en beperkings te verstaan ​​en om dit wyslik te gebruik, hetsy in die konteks van diagnose of navorsing!  

Lees artikel

Luister na 'n podcast-onderhoud oor hierdie artikel:

  Luister nou

 

Tweet